Diagnóstico rápido de COVID-19 em amostras de urina utilizando a MasSpec Pen
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Tipo
Dissertação
Data de publicação
2023-02-02
Periódico
Citações (Scopus)
Autores
Santos, Alicia Camacho dos
Orientador
Eberlin, Marcos Nogueira
Título da Revista
ISSN da Revista
Título de Volume
Membros da banca
Silva, Cecília de Carvalho Castro e
Porcari, Andréia de Melo
Porcari, Andréia de Melo
Programa
Engenharia de Materiais e Nanotecnologia
Resumo
A COVID-19 é uma doença respiratória causada pelo vírus SARS-CoV-2, que se disseminou rapidamente gerando uma crise em escala global. A testagem em massa e diagnóstico na fase inicial da doença são medidas necessárias no combate da disseminação do vírus. Atualmente, o teste padrão ouro para diagnóstico da doença é a técnica de reação em cadeia da polimerase de transcrição reversa em tempo real (RT-qPCR, do inglês reverse transcription- quantitative polymerase chain reaction), o qual possui limitações em relação a sensibilidade, disponibilidade de insumos e até tempo prolongado de realização. Nesse contexto, torna-se relevante o desenvolvimento de novos testes que permitam a obtenção do diagnóstico de modo
confiável e rápido. O objetivo desse projeto foi identificar assinaturas moleculares para o diagnóstico da COVID-19 em amostras de urina, utilizando o sistema MasSpec Pen acoplado a um espectrômetro de massas. Foram analisadas 236 amostras de urina por esse sistema, sendo 133 amostras de pacientes hospitalizados com sintomas da COVID-19 e 103 amostras de voluntários saudáveis. Para análise estatística dos dados, foi usada regressão LASSO (método de regressão penalizado, para seleção de variáveis) e o recurso de validação cruzada leave-one out. O classificador estatístico foi construído com base nos perfis de metabólitos das amostras de pacientes hospitalizados com diagnóstico positivo pelo teste de RT-qPCR, e voluntários
assintomáticos com resultados negativo. Obteve-se parâmetros de sensibilidade de (100% e 89%), especificidade (100% e 96%), e acurácia (100% e 94%) nos conjuntos de treinamento e validação, respectivamente. O modelo também foi testado em dois conjuntos de amostras retidas, compostos por amostras de pacientes internados com sintomas da COVID-19 mas com
diagnóstico negativo (N=23), e amostras que não atenderam aos critérios do período de coleta em relação ao início dos sintomas e data da coleta do swab para o RT-qPCR (N=71). Esses dados sugerem a análise da urina com a MasSpec Pen e Espectrometria de massas como uma metodologia promissora para diagnóstico rápido da COVID-19, com poucas etapas de pré processamento, sem a necessidade de reagentes caros e com elevada sensibilidade e especificidade.
Descrição
Palavras-chave
espectrometria de massas , massspec pen , COVID-19 , urina , perfil molecular , diagnóstico